Es un doctorado de investigación, en donde se espera que el estudiante doctoral se incorpore a la dinámica de investigación del CINPE, directamente a través de uno de sus núcleos de trabajo. Es deseable que este vínculo se realice a tiempo completo, o en su defecto, con un mínimo de 20 horas presenciales. De esta manera el doctorando pasa a ser parte de equipo de investigación del núcleo de interés, en donde su proyecto de investigación se incorpora oficialmente a la agenda de trabajo del instituto, bajo la supervisión de uno de los académicos de planta.
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